Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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