Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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ECM1Q16610 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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ECM1Q16610 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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ECM1Q16610 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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ECM1Q16610 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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ECM1Q16610 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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