Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FXNQ16595 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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