Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms