Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms