Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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