Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18Q15532 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SS18Q15532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SS18Q15532 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SS18Q15532 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SS18Q15532 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SS18Q15532 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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