Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms