Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERV3-1Q14264 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms