Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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