Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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