Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms