Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALKBH1Q13686 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms