Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms