Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CDH18Q13634 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CDH18Q13634 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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