Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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