Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SEMA3FQ13275 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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