Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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