Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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