Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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TRAF2Q12933 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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