Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TP53BP1Q12888 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TP53BP1Q12888 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TP53BP1Q12888 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TP53BP1Q12888 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TP53BP1Q12888 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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