Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms