Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms