Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms