Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAV1Q03135 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms