Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms