Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3AP84243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms