Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms