Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A1P60842 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms