Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms