Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms