Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms