Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX2P52951 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms