Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT4P50991 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT4P50991 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT4P50991 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT4P50991 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT4P50991 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT4P50991 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms