Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms