Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTPAP49638 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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