Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA4P48169 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms