Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms