Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms