Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms