Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms