Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms