Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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