Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms