Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms