Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms