Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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