Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms