Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD4O60885 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD4O60885 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD4O60885 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD4O60885 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms