Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms